Vad är RNA sekvense?

October 11

RNA-sekvensering är en process för bestämning av sekvensen av nukleotider i en sträng av ribonukleinsyra, eller RNA. RNA består av fyra nukleotider kallas adenin (A), guanin (G), cytosin (S) och uracil (S). Den särskilda sekvensen av nukleotiderna är en "kod" som innehåller genetisk information som används för att producera olika typer av proteiner eller för att tjäna någon specifik funktion på egen hand. Genetiska koder i form av sekvenser av nukleotider definierar nästan varje biologisk process med utvecklingen och funktionen hos en organism. RNA-sekvensering, alltså en typ av forskning som syftar till att upptäcka den exakta arten av den genetiska koden och ansluta kod till specifika strukturer och funktioner inom en organism.

Forskare sekvens deoxiribonukleinsyra, eller DNA, mycket oftare än de sekvensera RNA. DNA är på liknande sätt består av nukleotider, men de är arrangerade i en dubbelspiral. RNA "transkriptioner" är faktiskt gjort baserat på sekvensen av nukleotider i en DNA-sträng - DNA tenderar att vara mer robust än RNA eftersom många RNA-strängar måste göras från en enda sekvens av DNA. Dessutom innehåller DNA "introner", eller icke-kodande segment av DNA, som redigeras under transkriptionsprocessen och är därför inte upptäcks av RNA-sekvensering. RNA-sekvensering är fortfarande viktigt, men i många fall är det nödvändigt att först "omvänd transkribera" RNA tillbaka till DNA innan sekvense det.

Det faktum att en RNA-sekvens är inte nödvändigtvis detsamma som DNA-sekvensen från vilken den transkriberas är en av de främsta anledningarna till att forskarna bedriver faktiskt RNA sekvenseexperiment. RNA-sekvensering kan forskare upptäcka vilka delar av en DNA-mall redigerades ut under transkription. Att veta detta, kan de sedan undersöka hur och varför sekvensen redigerades ut. Ett av de intressanta problem inom biologin är det faktum att en stor del av genomet, eller summering av genetisk information inom en organism, verkar vara oanvänd. Lära exakt vilka sekvenser används och som inte är ett viktigt steg i att utforska den invecklade dessa oanvända segment av genetisk information.

Utveckla mer effektiva och effektiva metoder för RNA-sekvensering är ett viktigt fokus för många forskare i bioteknik. Forskare måste generellt omvänd transkribera RNA till DNA innan faktiskt tar sekvensen. Forskare vill utveckla metoder som möjliggör effektiv direkt sekvensering av RNA utan att skada RNA-strängar. Dessutom forskare vill hitta hög kapacitet metoder som tillåter dem att sekvensera många RNA-strängar under en RNA-sekvenseprocess.

  • Forskare sekvensera mer vanligt DNA än RNA.