Vad är en retrotransposon?

January 31

Transposoner är bitar av DNA som är mobila, eller kan flytta till olika platser inom genetisk information i en cell. Genom att flytta till en ny plats inom genomet hos en cell, kan transposoner orsaka mutationer inträffar, samt ändra mängden DNA inom cellen. De är också till som hoppande gener, och är grupperade i två kategorier, vilka är klass Il-transposoner och klass I transposoner eller retrotransposoner. Skillnaden mellan dessa två klasser har att göra med hur de rör sig; en retrotransposon har en två-stegs rörelsen process.

Metoden för förflyttning av DNA-segment är hur transposonerna klassificeras i varje kategori. En klass II transposon är ett stycke DNA som rör sig från en plats till en annan. Förflyttningen av ett klass I transposon eller retrotransposon, är mycket mer komplex, och omfattar två steg för rörelsen av DNA-segment.

Det första steget för förflyttning av en retrotransposon är att skapa ett segment av RNA genom transkription av en bit av DNA. RNA är nu fri att röra sig genom hela genomet, eftersom det inte är bunden till en DNA-sträng. När RNA når den nya platsen, ett särskilt enzym, kallat omvänt transkriptas, gör en ny DNA-sträng baserad på RNA-segmentet. Denna nya DNA-stycke fästs sedan till den nya platsen inom genomet.

När en retrotransposon transkriberas tillbaka in ett DNA-segment från RNA-kopia, vanligtvis har det långa terminala upprepningar (LTR) i slutet av DNA-sekvensen. LTRs består av upprepande sekvenser av baser som kan vara hundratals eller tusentals baser lång. De omger vanligtvis en funktionell del av DNA, såsom en gen, och är nödvändiga för att fästa DNA-segmentet till den ursprungliga DNA-strängen. LTRs är ett sätt att forskarna kan erkänna att en del av DNA innehåller ett retrotransposon. Man tror att ungefär 42% av hela människans arvsmassa består av retrotransposoner.

På grund av det faktum att nya kopior av DNA sker via omvänd transkription av RNA, tillsätta en retrotransposon är ett sätt att öka mängden DNA som finns inom en enda cell. Om en retrotransposon infogas inom en gen eller i närheten av en gen, då det kan orsaka en mutation att uppstå. Mutationer är i grunden ändras till DNA-sekvensen och kan ha positiv, negativ eller ingen påverkan på genomet, beroende på hur sekvensen för DNA förändras.

  • Transposoner är bitar av DNA som är mobila.