Vad är en exopeptidas?

April 17

Inom matsmältningssystemet, det finns många olika enzymer som bryter ner mat molekyler. Var och en av dessa enzymer har en annan roll och vissa endast agera på ett visst organ under vissa förutsättningar. De flesta matsmältningen sker i tunntarmen av ett stort antal olika enzymer. Den nedbrytning av proteiner är ett exempel på en komplex process som utförs i olika organ av olika grupper av enzymer. Exopeptidaser är en grupp av enzymer som är involverade i fullständig nedbrytning av proteiner.

Spjälkningen av en proteinmolekyl är mycket specifik, eftersom enzymerna involverade endast bryta bindningarna bredvid vissa aminosyror inom peptidkedjan. När en peptidbindning bildas, är det alltid mellan aminoänden av en aminosyra och karboxylgruppen änden av en annan. När aminosyrasekvensen ges för en särskild peptidkedja, eller protein, är det vanligtvis läses från aminoänden, N-terminala, till den sista aminosyran, som har en fri karboxylgrupp, eller C-terminalen. Inledningsvis, även om proteinet bryts ned, är mycket få aminosyror produceras.

Proteiner är stora molekyler och deras matsmältning har ett antal steg, med början i magen av pepsin, en av tre endopeptidaser. När de delvis spjälkade proteiner flyttar från magen till tunntarmen, de andra två endopeptidaser, trypsin och kymotrypsin, fortsätter att bryta ner proteiner. Dessa tre enzymer dela de långa peptid strängarna som utgör protein i varierande längder. Endopeptidaser kallas så eftersom de bryter ner peptidbindningar inom proteinet.

För att slutföra matsmältningen att producera enstaka aminosyror från en proteinkedja, behövs en exopeptidas. Varje exopeptidas bryter bindningen mellan slutet aminosyran och resten av kedjan. Det finns flera olika exopeptidaser, vilka vardera har en mycket specifik verkningsmekanism. När aminosyran är bunden till resten av peptidkedjan och vilka aminosyror sammanfogas spelar en roll i att bestämma vilken exopeptidas kommer att bryta bindningen.

Karboxipeptidas är ett exopeptidas som bryter bindningen mellan den näst sista och den sista aminosyran i den C-terminala änden. En annan exopeptidas, aminopeptidas, utför samma åtgärd men vid N-terminala änden. Andra exopeptidaser, kallade dipeptidaser, bryta isär särskilda par av aminosyror. Till exempel kommer ett dipeptidas endast bryta bindningen mellan en glycin länkad med en leucin. En annan dipeptidaset kommer bara agera på en peptidbindning mellan två glycin aminosyror kopplas samman.